Das Münzenbergmuseum geht auf den Entdeckergeist und die private Initiative von Professor Dr. Siegfried Behrens, zurück, der in den 1990er Jahren zusammen mit seiner Frau ein kleines Haus auf dem Münzenberg kaufte. Bei den Renovierungsarbeiten stieß er auf die Überreste der ehemaligen Klosterkirche St. Marien. Durch die Ankäufe weiterer Häuser und Tauschgeschäfte setzte Siegfried Behrens die alte Kirchenruine Stück für Stück wieder zusammen und machte sie mit Hilfe eines Museumsvereins der Öffentlichkeit zugänglich.